Para cumplir con su misión, las actividades del Instituto DESARROLLO se organizan en base a tres ejes principales: (a) la docencia, que incluye la formación de post-grado y la formación ejecutiva, (b) la investigación y (c) la asistencia técnica.
En el área de investigación, el Instituto ha elaborado conjuntamente con el Programa de las Naciones Unidas para el Desarrollo (PNUD) en Paraguay el Informe Nacional de Desarrollo Humano 2003. Fue el responsable de la elaboración del Atlas del Desarrollo Humano al Nivel Municipal en Paraguay, y de análisis estadísticos sobre los factores determinantes del desarrollo local. El Instituto es igualmente el responsable del caso paraguayo en la Red de Investigación PNUD-CEPAL (Comisión Económica para América Latina y el Caribe) sobre Estrategias de Crecimiento basado en Exportaciones. En este marco ha desarrollado un modelo de equilibrio general computable basado en una matriz de contabilidad social, que permitirá analizar los efectos de las políticas macroeconómicas en los diversos sectores, tipos de hogares y regiones en Paraguay.
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El Instituto ha realizado trabajos de investigación econométricos en el área de economía de la educación. En estos se han estimado el retorno a la educación por segmento social diferenciado por área, género e idioma hablado en la casa; ha estimado los determinantes del rendimiento educativo en secundaria, así como realizado evaluaciones del gasto en educación para detectar áreas potenciales de aumento de eficiencia. Estas investigaciones fueron financiadas por el Banco Mundial. El Instituto se encuentra actualmente trabajando en la evaluación de un Programa Nacional de Salud (La Misión Médica Cubana en Paraguay) y su impacto para reducir la mortalidad maternal e infantil de acuerdo a los Objetivos del Milenio, este proyecto esta financiado por el Banco Mundial. Se encuentra igualmente trabajando en un proyecto sobre Capital Social, Organizaciones de la Sociedad Civil y Gobernabilidad, financiado por el Banco Interamericano de Desarrollo (BID).
Desarrollo ha ganado en diciembre 2003, una consultoría nacional para la elaboración de Programas de Capacitación para docentes, y padres, madres y/o encargados con el fin de fortalecer la relación familia-escuela, del Programa de Mejoramiento de la Educación Inicial y Preescolar del Ministerio de Educación y Cultura y el BID.
En el área de capacitación y educación, el Instituto tienen acuerdos de cooperación con la Universidad San Andrés de Buenos Aires (Argentina) para la organización de programas de actualización y formación continua en finanzas y economía; y con la George Washington University (USA) a través de su Centro para Asuntos Latinoamericanos, para la organización de programas de actualización y formación continua en negocios internacionales. El Instituto ha organizado cursos de Gerencia para el Desarrollo dirigido a emprendedores de proyectos de inversión con impacto positivo en el medio ambiente y con marcada responsabilidad social de los proyectos. Finalmente, el Instituto ha organizado cursos de capacitación en Diseño, Gestión y Monitoreo de Proyectos Sociales dirigido a líderes locales. El instituto esta colaborando con el PNUD en la capacitación a líderes locales en proyectos para el desarrollo tanto en Camerún (África) como en Albania (Europa del Este).
En el área de asistencia técnica, el Instituto DESARROLLO se encuentra asesorando a líderes y autoridades de la comunidad de Carapeguá en el diseño de una estrategia de desarrollo municipal integral. Esta estrategia de desarrollo apunta a diseñar e implementar, con la activa participación comunitaria, un programa que permitirá lograr exitosamente los Objetivos de Desarrollo del Milenio fijado en la Cumbre de las Naciones Unidas en Nueva York en Septiembre del 2000. Este proyecto se inició con financiamiento del Fondo Canadá para Iniciativas Locales y recibió igualmente el apoyo del PNUD.
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Gracias a esta asistencia técnica, Carapeguá es el primer municipio en el mundo que adopto una legislación por consenso donde establece lo siguiente: (a) Las metas del milenio es el eje principal de la estrategia de gobierno municipal (ejecutivo y legislativo), (b) el presupuesto del municipio debe reflejar adecuadamente las metas del milenio tal cual lo priorizan sus habitantes en forma participativa, y (c) se institucionalizara la participación permanente de la sociedad civil en el monitoreo y asesoramiento de este proceso a través de la instauración de un concejo de desarrollo comunitario compuestos por representantes del gobierno municipal y de la sociedad civil organizada.
El proyecto ha sido identificado por varias agencias de cooperación para el desarrollo como una experiencia innovadora, y esta siendo diseminada mundialmente con el apoyo de las mismas. En este sentido, el PNUD destaca en carácter innovador del proyecto tanto en su boletín Primicias como en el Poverty Newsletter, ambos difundidos en dos idiomas (español e inglés). LA radio de las Naciones Unidas ha dedicado un par de reportajes al proyecto, destacando igualmente su carácter innovador. La experiencia ha sido presentada y sistematizada para una sesión de experiencias innovadoras en gerencia social organizada por el Instituto Interamericano para el Desarrollo Social (INDES) del BID, a sí mismo por considerarse una experiencia innovadora el Instituto ha sido invitado a presentar la experiencia de Carapeguá en la India (Marzo 2003), en México (Mayo 2003), en Venezuela (Junio 2003), en Honduras (Agosto 2003), y en Brasil (Septiembre 2003).